Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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PTPRTO14522 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRTO14522 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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