Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KLF9Q13886 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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