Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRIP3Q6Q6R5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms