Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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FOXD4Q12950 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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FOXD4Q12950 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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FOXD4Q12950 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FOXD4Q12950 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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