Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPN13Q12923 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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