Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRTO14522 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRTO14522 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
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