Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms