Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFLP07196 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFLP07196 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEFLP07196 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NEFLP07196 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEFLP07196 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFLP07196 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFLP07196 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms