Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARID3CA6NKF2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms