Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.25
PTPN13Q12923 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PTPN13Q12923 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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PTPN13Q12923 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PTPN13Q12923 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PTPN13Q12923 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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PTPN13Q12923 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPN13Q12923 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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