Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPRTO14522 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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