Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN13Q12923 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN13Q12923 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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