Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fip1l1Q9D824 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fip1l1Q9D824 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fip1l1Q9D824 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fip1l1Q9D824 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fip1l1Q9D824 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fip1l1Q9D824 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fip1l1Q9D824 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fip1l1Q9D824 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms