Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0S9

Snapc1, snRNA-activating protein complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc1Q8K0S9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snapc1Q8K0S9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snapc1Q8K0S9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snapc1Q8K0S9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snapc1Q8K0S9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.3 ms