Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pan3Q640Q5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pan3Q640Q5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pan3Q640Q5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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