Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms