Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bod1Q5SQY2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bod1Q5SQY2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bod1Q5SQY2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bod1Q5SQY2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms