Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc177Q3UHB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc177Q3UHB8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc177Q3UHB8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc177Q3UHB8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms