Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YNL190WYNL190W 615 nt8.05□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 YLR173WYLR173W 1827 nt8.05□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 SLM3YDL033C 1254 nt8.04□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 URH1YDR400W 1023 nt8.04□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 YDR467CYDR467C 327 nt8.03□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.03□□□□□ -1.12
SGO1Q08490 FTH1YBR207W 1398 nt8.02□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 PIH1YHR034C 1035 nt8.02□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 LAS17YOR181W 1902 nt8.01□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 PFS2YNL317W 1398 nt8.01□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt8.01□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 MAS2YHR024C 1449 nt8.01□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 NCA3YJL116C 1014 nt8□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 HSV2YGR223C 1347 nt8□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 REG2YBR050C 1017 nt7.99□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 RHO1YPR165W 630 nt7.99□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 YOX1YML027W 1158 nt7.97□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 CPT1YNL130C 1182 nt7.97□□□□□ -1.13
SGO1Q08490 YTH1YPR107C 627 nt7.96□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 GCD11YER025W 1584 nt7.96□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 MCM5YLR274W 2328 nt7.95□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 SHC1YER096W 1539 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 PNS1YOR161C 1620 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 POR2YIL114C 846 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 YLR122CYLR122C 378 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 AIM34YMR003W 597 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 PUS4YNL292W 1212 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 ATP23YNR020C 813 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 SPR1YOR190W 1338 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 AAT1YKL106W 1356 nt7.94□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.93□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 THI73YLR004C 1572 nt7.93□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 PUS7YOR243C 2031 nt7.92□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 JHD1YER051W 1479 nt7.92□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.91□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 PUP3YER094C 618 nt7.91□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 PMU1YKL128C 888 nt7.91□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 MDH2YOL126C 1134 nt7.91□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 DIA4YHR011W 1341 nt7.91□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 YLR072WYLR072W 2082 nt7.9□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 UME1YPL139C 1383 nt7.9□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 YIR035CYIR035C 765 nt7.9□□□□□ -1.14
SGO1Q08490 THI3YDL080C 1830 nt7.89□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 GGA2YHR108W 1758 nt7.89□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 TIM50YPL063W 1431 nt7.89□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 PAM17YKR065C 594 nt7.89□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 ARA2YMR041C 1008 nt7.89□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 YBL111CYBL111C 2004 nt7.89□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 FAF1YIL019W 1041 nt7.88□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 MCP1YOR228C 909 nt7.88□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 ECM10YEL030W 1935 nt7.88□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 CHA1YCL064C 1083 nt7.87□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 GPM1YKL152C 744 nt7.87□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 ITR1YDR497C 1755 nt7.87□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 CYS3YAL012W 1185 nt7.86□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 APT1YML022W 564 nt7.86□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 PMA2YPL036W 2844 nt7.86□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 FRT1YOR324C 1809 nt7.85□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 PRC1YMR297W 1599 nt7.84□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 PMT7YDR307W 1989 nt7.84□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 YIL177CYIL177C 5277 nt7.84□□□□□ -1.15
SGO1Q08490 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.84□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.84□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.84□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 ADE2YOR128C 1716 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 KDX1YKL161C 1302 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 TOP3YLR234W 1971 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 CRN1YLR429W 1956 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 GAL83YER027C 1254 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 TOM20YGR082W 552 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 PUS5YLR165C 765 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 PRE10YOR362C 867 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 YMC2YBR104W 990 nt7.83□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 MEP1YGR121C 1479 nt7.82□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 BUB2YMR055C 921 nt7.82□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 TMS1YDR105C 1422 nt7.81□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 PTH2YBL057C 627 nt7.81□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 YPQ1YOL092W 927 nt7.81□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 ZIM17YNL310C 525 nt7.8□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 AAD14YNL331C 1131 nt7.8□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 LEA1YPL213W 717 nt7.8□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 PMP3YDR276C 168 nt7.79□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 AIM46YHR199C 933 nt7.79□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 AAC3YBR085W 924 nt7.79□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 GGC1YDL198C 903 nt7.78□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 SPE3YPR069C 882 nt7.78□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 MAM3YOL060C 2121 nt7.78□□□□□ -1.16
SGO1Q08490 NDE1YMR145C 1683 nt7.77□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 FHN1YGR131W 525 nt7.77□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 ADH6YMR318C 1083 nt7.77□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 MBF1YOR298C-A 456 nt7.77□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 HXT8YJL214W 1710 nt7.77□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 SPE4YLR146C 903 nt7.76□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 ATP10YLR393W 840 nt7.76□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 CST26YBR042C 1194 nt7.76□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 ABP1YCR088W 1779 nt7.76□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 SNU66YOR308C 1764 nt7.76□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 PLB3YOL011W 2061 nt7.75□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 CKI1YLR133W 1749 nt7.75□□□□□ -1.17
SGO1Q08490 YMR074CYMR074C 438 nt7.75□□□□□ -1.17
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