Protein–RNA interactions for Protein: Q08285

RRP40, Exosome complex component RRP40, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP40Q08285 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 TDA4YJR116W 840 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 WSC3YOL105C 1671 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 GLY1YEL046C 1164 nt7.34□□□□□ -1.23
RRP40Q08285 TGL5YOR081C 2250 nt7.34□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 ADE1YAR015W 921 nt7.33□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 ALG7YBR243C 1347 nt7.32□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 YGR137WYGR137W 375 nt7.32□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.32□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 FTH1YBR207W 1398 nt7.32□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 TIF3YPR163C 1311 nt7.31□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.31□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.31□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.31□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 RPL12BYDR418W 498 nt7.31□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 WSC4YHL028W 1818 nt7.31□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 MRN1YPL184C 1839 nt7.31□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 HSV2YGR223C 1347 nt7.3□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 NUP53YMR153W 1428 nt7.3□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 ARO3YDR035W 1113 nt7.3□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 INM1YHR046C 888 nt7.3□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 YNL140CYNL140C 570 nt7.3□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.3□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 AIM34YMR003W 597 nt7.29□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 GNP1YDR508C 1992 nt7.29□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 ARG7YMR062C 1326 nt7.28□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 MRP7YNL005C 1116 nt7.28□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 DIA4YHR011W 1341 nt7.27□□□□□ -1.24
RRP40Q08285 MAS1YLR163C 1389 nt7.27□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 TOS1YBR162C 1368 nt7.27□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 PSP2YML017W 1782 nt7.26□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 SLM3YDL033C 1254 nt7.26□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 YJL043WYJL043W 774 nt7.26□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 MDH2YOL126C 1134 nt7.26□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 APT1YML022W 564 nt7.25□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 NDE1YMR145C 1683 nt7.25□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 EDC2YER035W 438 nt7.24□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 SNP1YIL061C 903 nt7.24□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 FUS3YBL016W 1062 nt7.24□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 ITR1YDR497C 1755 nt7.23□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 FRT1YOR324C 1809 nt7.23□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 HAC1YFL031W 717 nt7.23□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 SPR1YOR190W 1338 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP40Q08285 CHA1YCL064C 1083 nt7.21□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 KAE1YKR038C 1161 nt7.21□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 CPT1YNL130C 1182 nt7.21□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 KTR4YBR199W 1395 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 PMA2YPL036W 2844 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 PNS1YOR161C 1620 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 BEM1YBR200W 1656 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 TOP3YLR234W 1971 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 PRC1YMR297W 1599 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 PET494YNR045W 1470 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 YDR476CYDR476C 675 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 RRT6YGL146C 936 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 CPR2YHR057C 618 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 PMT7YDR307W 1989 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 ELP6YMR312W 822 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 MNN9YPL050C 1188 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 MTC6YHR151C 1581 nt7.17□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 DST1YGL043W 930 nt7.17□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 GGC1YDL198C 903 nt7.16□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 ATP10YLR393W 840 nt7.15□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 YOR268CYOR268C 399 nt7.15□□□□□ -1.26
RRP40Q08285 STE3YKL178C 1413 nt7.14□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 CDA1YLR307W 906 nt7.14□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 CTF3YLR381W 2202 nt7.13□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 YEL023CYEL023C 2049 nt7.13□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.13□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 SPE4YLR146C 903 nt7.13□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 YPL264CYPL264C 1062 nt7.13□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 AOS1YPR180W 1044 nt7.13□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 TPO1YLL028W 1761 nt7.11□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 HAM1YJR069C 594 nt7.11□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 YNL295WYNL295W 1575 nt7.11□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 RRP43YCR035C 1185 nt7.1□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 NCA3YJL116C 1014 nt7.1□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 TES1YJR019C 1050 nt7.1□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 CRN1YLR429W 1956 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 CCR4YAL021C 2514 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 ERR3YMR323W 1314 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 ERR1YOR393W 1314 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 ERR2YPL281C 1314 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 ERV2YPR037C 591 nt7.09□□□□□ -1.27
RRP40Q08285 PMT1YDL095W 2454 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 STF1YDL130W-A 261 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 YHR033WYHR033W 1272 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 INP54YOL065C 1155 nt7.08□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 YLR358CYLR358C 564 nt7.07□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.07□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 YMR253CYMR253C 1245 nt7.07□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 MET13YGL125W 1803 nt7.06□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 AVL9YLR114C 2295 nt7.06□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 HXT9YJL219W 1704 nt7.05□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 CKB1YGL019W 837 nt7.05□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 STS1YIR011C 960 nt7.05□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 BAP3YDR046C 1815 nt7.05□□□□□ -1.28
RRP40Q08285 PSA1YDL055C 1086 nt7.04□□□□□ -1.28
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