Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnfP51944 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcnfP51944 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcnfP51944 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CcnfP51944 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcnfP51944 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnfP51944 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnfP51944 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcnfP51944 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnfP51944 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CcnfP51944 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnfP51944 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcnfP51944 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnfP51944 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnfP51944 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcnfP51944 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnfP51944 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnfP51944 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcnfP51944 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms