Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CcnfP51944 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CcnfP51944 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CcnfP51944 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CcnfP51944 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CcnfP51944 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CcnfP51944 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CcnfP51944 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CcnfP51944 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CcnfP51944 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CcnfP51944 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CcnfP51944 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CcnfP51944 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CcnfP51944 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CcnfP51944 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CcnfP51944 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CcnfP51944 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CcnfP51944 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CcnfP51944 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CcnfP51944 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CcnfP51944 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CcnfP51944 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CcnfP51944 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CcnfP51944 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CcnfP51944 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CcnfP51944 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CcnfP51944 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CcnfP51944 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CcnfP51944 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CcnfP51944 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CcnfP51944 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CcnfP51944 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CcnfP51944 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CcnfP51944 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CcnfP51944 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CcnfP51944 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CcnfP51944 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CcnfP51944 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CcnfP51944 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CcnfP51944 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CcnfP51944 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CcnfP51944 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CcnfP51944 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CcnfP51944 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CcnfP51944 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CcnfP51944 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CcnfP51944 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CcnfP51944 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CcnfP51944 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CcnfP51944 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CcnfP51944 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CcnfP51944 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CcnfP51944 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CcnfP51944 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CcnfP51944 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CcnfP51944 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CcnfP51944 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CcnfP51944 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CcnfP51944 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CcnfP51944 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CcnfP51944 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CcnfP51944 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CcnfP51944 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CcnfP51944 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CcnfP51944 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CcnfP51944 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CcnfP51944 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CcnfP51944 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CcnfP51944 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CcnfP51944 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CcnfP51944 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CcnfP51944 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CcnfP51944 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CcnfP51944 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CcnfP51944 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CcnfP51944 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CcnfP51944 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CcnfP51944 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CcnfP51944 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CcnfP51944 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CcnfP51944 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CcnfP51944 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CcnfP51944 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CcnfP51944 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CcnfP51944 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CcnfP51944 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CcnfP51944 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CcnfP51944 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CcnfP51944 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CcnfP51944 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CcnfP51944 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CcnfP51944 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CcnfP51944 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CcnfP51944 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CcnfP51944 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CcnfP51944 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CcnfP51944 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CcnfP51944 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CcnfP51944 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CcnfP51944 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms