Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 BUD31YCR063W 474 nt6.5□□□□□ -1.37
AVT5P38176 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.5□□□□□ -1.37
AVT5P38176 HRA1HRA1 564 nt6.5□□□□□ -1.37
AVT5P38176 MEU1YLR017W 1014 nt6.5□□□□□ -1.37
AVT5P38176 HEL1YKR017C 1656 nt6.49□□□□□ -1.37
AVT5P38176 CKB1YGL019W 837 nt6.49□□□□□ -1.37
AVT5P38176 PHB2YGR231C 933 nt6.49□□□□□ -1.37
AVT5P38176 BUB2YMR055C 921 nt6.49□□□□□ -1.37
AVT5P38176 PGC1YPL206C 966 nt6.49□□□□□ -1.37
AVT5P38176 PDC5YLR134W 1692 nt6.49□□□□□ -1.37
AVT5P38176 RAD51YER095W 1203 nt6.48□□□□□ -1.37
AVT5P38176 YFR020WYFR020W 699 nt6.48□□□□□ -1.37
AVT5P38176 MOB1YIL106W 945 nt6.48□□□□□ -1.37
AVT5P38176 ADH3YMR083W 1128 nt6.48□□□□□ -1.37
AVT5P38176 YBR056WYBR056W 1506 nt6.48□□□□□ -1.37
AVT5P38176 AVL9YLR114C 2295 nt6.48□□□□□ -1.37
AVT5P38176 RQC1YDR333C 2172 nt6.48□□□□□ -1.37
AVT5P38176 ERG12YMR208W 1332 nt6.48□□□□□ -1.37
AVT5P38176 YJR149WYJR149W 1215 nt6.47□□□□□ -1.37
AVT5P38176 HSM3YBR272C 1443 nt6.47□□□□□ -1.37
AVT5P38176 RUP1YOR138C 2016 nt6.47□□□□□ -1.37
AVT5P38176 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt6.46□□□□□ -1.38
AVT5P38176 YLR460CYLR460C 1131 nt6.46□□□□□ -1.38
AVT5P38176 CDC23YHR166C 1881 nt6.45□□□□□ -1.38
AVT5P38176 TDA4YJR116W 840 nt6.45□□□□□ -1.38
AVT5P38176 YBR232CYBR232C 360 nt6.45□□□□□ -1.38
AVT5P38176 PEX28YHR150W 1740 nt6.45□□□□□ -1.38
AVT5P38176 ECM30YLR436C 3825 nt6.44□□□□□ -1.38
AVT5P38176 MRP7YNL005C 1116 nt6.44□□□□□ -1.38
AVT5P38176 YJL045WYJL045W 1905 nt6.44□□□□□ -1.38
AVT5P38176 FLX1YIL134W 936 nt6.43□□□□□ -1.38
AVT5P38176 SNA3YJL151C 402 nt6.43□□□□□ -1.38
AVT5P38176 CYC3YAL039C 810 nt6.43□□□□□ -1.38
AVT5P38176 CAN1YEL063C 1773 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 GTS1YGL181W 1191 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 CHS7YHR142W 951 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 SRP102YKL154W 735 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 IPL1YPL209C 1104 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 PDC6YGR087C 1692 nt6.42□□□□□ -1.38
AVT5P38176 RRN10YBL025W 438 nt6.41□□□□□ -1.38
AVT5P38176 OLA1YBR025C 1185 nt6.41□□□□□ -1.38
AVT5P38176 YBL113CYBL113C 2379 nt6.41□□□□□ -1.38
AVT5P38176 DCR2YLR361C 1737 nt6.41□□□□□ -1.38
AVT5P38176 EMP65YER140W 1671 nt6.4□□□□□ -1.38
AVT5P38176 KIN1YDR122W 3195 nt6.4□□□□□ -1.38
AVT5P38176 CSM2YIL132C 642 nt6.4□□□□□ -1.38
AVT5P38176 HHY1YEL059W 309 nt6.39□□□□□ -1.39
AVT5P38176 YLR280CYLR280C 351 nt6.39□□□□□ -1.39
AVT5P38176 GRH1YDR517W 1119 nt6.38□□□□□ -1.39
AVT5P38176 SNF4YGL115W 969 nt6.38□□□□□ -1.39
AVT5P38176 AIM2YAL049C 741 nt6.38□□□□□ -1.39
AVT5P38176 SEC23YPR181C 2307 nt6.37□□□□□ -1.39
AVT5P38176 CLN1YMR199W 1641 nt6.37□□□□□ -1.39
AVT5P38176 MET22YOL064C 1074 nt6.37□□□□□ -1.39
AVT5P38176 SKY1YMR216C 2229 nt6.37□□□□□ -1.39
AVT5P38176 SMC5YOL034W 3282 nt6.37□□□□□ -1.39
AVT5P38176 MLS1YNL117W 1665 nt6.36□□□□□ -1.39
AVT5P38176 FLC2YAL053W 2352 nt6.36□□□□□ -1.39
AVT5P38176 EHT1YBR177C 1356 nt6.36□□□□□ -1.39
AVT5P38176 PAC10YGR078C 600 nt6.36□□□□□ -1.39
AVT5P38176 YOR012WYOR012W 414 nt6.36□□□□□ -1.39
AVT5P38176 ENB1YOL158C 1821 nt6.36□□□□□ -1.39
AVT5P38176 LEO1YOR123C 1395 nt6.35□□□□□ -1.39
AVT5P38176 DIP5YPL265W 1827 nt6.35□□□□□ -1.39
AVT5P38176 YGR137WYGR137W 375 nt6.35□□□□□ -1.39
AVT5P38176 TES1YJR019C 1050 nt6.35□□□□□ -1.39
AVT5P38176 ELP6YMR312W 822 nt6.35□□□□□ -1.39
AVT5P38176 EFM1YHL039W 1758 nt6.35□□□□□ -1.39
AVT5P38176 CBK1YNL161W 2271 nt6.35□□□□□ -1.39
AVT5P38176 ERO1YML130C 1692 nt6.35□□□□□ -1.39
AVT5P38176 WSC3YOL105C 1671 nt6.34□□□□□ -1.39
AVT5P38176 YCR025CYCR025C 411 nt6.34□□□□□ -1.39
AVT5P38176 RCF1YML030W 480 nt6.34□□□□□ -1.39
AVT5P38176 RNA170RNA170 169 nt6.34□□□□□ -1.39
AVT5P38176 SMK1YPR054W 1167 nt6.34□□□□□ -1.39
AVT5P38176 MTC6YHR151C 1581 nt6.34□□□□□ -1.39
AVT5P38176 PRP2YNR011C 2631 nt6.33□□□□□ -1.4
AVT5P38176 VMA2YBR127C 1554 nt6.33□□□□□ -1.4
AVT5P38176 YJL043WYJL043W 774 nt6.33□□□□□ -1.4
AVT5P38176 ARO3YDR035W 1113 nt6.32□□□□□ -1.4
AVT5P38176 MGM101YJR144W 810 nt6.32□□□□□ -1.4
AVT5P38176 CDA1YLR307W 906 nt6.32□□□□□ -1.4
AVT5P38176 RSP5YER125W 2430 nt6.32□□□□□ -1.4
AVT5P38176 OCH1YGL038C 1443 nt6.32□□□□□ -1.4
AVT5P38176 SGE1YPR198W 1632 nt6.32□□□□□ -1.4
AVT5P38176 YMR166CYMR166C 1107 nt6.31□□□□□ -1.4
AVT5P38176 HTS1YPR033C 1641 nt6.3□□□□□ -1.4
AVT5P38176 SER2YGR208W 930 nt6.3□□□□□ -1.4
AVT5P38176 ALG7YBR243C 1347 nt6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms