Protein–RNA interactions for Protein: P0CF16

YML003W, UPF0507 protein YML003W, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML003WP0CF16 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.89□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.89□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.89□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.89□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.89□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 FCY1YPR062W 477 nt6.89□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 TMS1YDR105C 1422 nt6.89□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 SNU66YOR308C 1764 nt6.89□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YER152CYER152C 1332 nt6.88□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 RRT6YGL146C 936 nt6.88□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 ARA2YMR041C 1008 nt6.88□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YMR253CYMR253C 1245 nt6.88□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YNL140CYNL140C 570 nt6.88□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YPL108WYPL108W 507 nt6.88□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 CHS7YHR142W 951 nt6.87□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YJL009WYJL009W 327 nt6.87□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 MET13YGL125W 1803 nt6.86□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YIR035CYIR035C 765 nt6.86□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YMR166CYMR166C 1107 nt6.86□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.86□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 YJL211CYJL211C 444 nt6.85□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 OLA1YBR025C 1185 nt6.85□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 CTF3YLR381W 2202 nt6.85□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.84□□□□□ -1.31
YML003WP0CF16 SGF73YGL066W 1974 nt6.83□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 MRN1YPL184C 1839 nt6.82□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 AQR1YNL065W 1761 nt6.82□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 YBR056WYBR056W 1506 nt6.81□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 MEP1YGR121C 1479 nt6.81□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 SGV1YPR161C 1974 nt6.81□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 GLY1YEL046C 1164 nt6.81□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 INM1YHR046C 888 nt6.81□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 MAM3YOL060C 2121 nt6.81□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 LSP1YPL004C 1026 nt6.81□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 INO1YJL153C 1602 nt6.8□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 RRT14YIL127C 621 nt6.8□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 SWP1YMR149W 861 nt6.8□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 EEB1YPL095C 1371 nt6.8□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 BUD31YCR063W 474 nt6.79□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 BUB2YMR055C 921 nt6.79□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 POB3YML069W 1659 nt6.79□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 TGL5YOR081C 2250 nt6.79□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 ECM10YEL030W 1935 nt6.78□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 OCH1YGL038C 1443 nt6.78□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 CAK1YFL029C 1107 nt6.78□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 LRO1YNR008W 1986 nt6.78□□□□□ -1.32
YML003WP0CF16 SNU71YGR013W 1863 nt6.77□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YJL160CYJL160C 864 nt6.77□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 MET22YOL064C 1074 nt6.77□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YJL045WYJL045W 1905 nt6.77□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 RSC9YML127W 1746 nt6.76□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YJR149WYJR149W 1215 nt6.76□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YHM2YMR241W 945 nt6.76□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 ATO2YNR002C 849 nt6.76□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YPR084WYPR084W 1371 nt6.76□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 NDE1YMR145C 1683 nt6.75□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.75□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 PDC6YGR087C 1692 nt6.74□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 KTR4YBR199W 1395 nt6.74□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YPT31YER031C 672 nt6.74□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 TDA4YJR116W 840 nt6.74□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 MFT1YML062C 1179 nt6.74□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 EHD3YDR036C 1503 nt6.72□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YLR030WYLR030W 792 nt6.72□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 YMR206WYMR206W 942 nt6.72□□□□□ -1.33
YML003WP0CF16 MAS2YHR024C 1449 nt6.71□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 GRH1YDR517W 1119 nt6.71□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 YER156CYER156C 1017 nt6.71□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 YIL108WYIL108W 2091 nt6.71□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 AFG2YLR397C 2343 nt6.71□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 YNL040WYNL040W 1371 nt6.7□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 PMT1YDL095W 2454 nt6.7□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 HRA1HRA1 564 nt6.7□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 YOR300WYOR300W 309 nt6.7□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 RHO1YPR165W 630 nt6.7□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 DIP5YPL265W 1827 nt6.69□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 CIT3YPR001W 1461 nt6.69□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 YER137CYER137C 447 nt6.69□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 RNA170RNA170 169 nt6.69□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 PZF1YPR186C 1290 nt6.69□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.68□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 PET18YCR020C 648 nt6.68□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 MRP1YDR347W 966 nt6.68□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 BUD20YLR074C 501 nt6.68□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 RPL12BYDR418W 498 nt6.67□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 MRP7YNL005C 1116 nt6.67□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 YOR343CYOR343C 327 nt6.67□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 YKR018CYKR018C 2178 nt6.67□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 YEL023CYEL023C 2049 nt6.66□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 PUP3YER094C 618 nt6.66□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 REG2YBR050C 1017 nt6.66□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 BNA3YJL060W 1335 nt6.66□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 NPL6YMR091C 1308 nt6.66□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 CKB1YGL019W 837 nt6.65□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 PMU1YKL128C 888 nt6.65□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 BXI1YNL305C 894 nt6.65□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 RPS6AYPL090C 711 nt6.65□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 RPS6BYBR181C 711 nt6.65□□□□□ -1.34
YML003WP0CF16 ADA2YDR448W 1305 nt6.65□□□□□ -1.35
YML003WP0CF16 GDH1YOR375C 1365 nt6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.4 ms