Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ13

Gm10608, Predicted gene 10608, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10608E9PZ13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10608E9PZ13 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm10608E9PZ13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm10608E9PZ13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm10608E9PZ13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm10608E9PZ13 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms