Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5640A3KG49 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5640A3KG49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5640A3KG49 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5640A3KG49 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5640A3KG49 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms