Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRTO14522 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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