Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRTO14522 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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