Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PFDN5Q99471 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms