Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGM1P36871 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGM1P36871 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGM1P36871 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGM1P36871 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGM1P36871 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGM1P36871 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGM1P36871 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGM1P36871 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGM1P36871 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms