Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCSO14618 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCSO14618 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCSO14618 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCSO14618 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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