Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRTO14522 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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