Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4bQ9ES61 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4bQ9ES61 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4bQ9ES61 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4bQ9ES61 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ms4a4bQ9ES61 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a4bQ9ES61 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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