Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2E1P29083 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms