Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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