Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3C1V9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3C1V9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3C1V9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3C1V9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3C1V9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1162.1 ms