Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms