Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2E1P29083 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms