Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EEA1Q15075 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
EEA1Q15075 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
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