Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms