Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEC24CP53992 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.9 ms