Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BccipQ9CWI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BccipQ9CWI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BccipQ9CWI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BccipQ9CWI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BccipQ9CWI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms