Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tlcd1Q99JT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tlcd1Q99JT6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tlcd1Q99JT6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tlcd1Q99JT6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlcd1Q99JT6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tlcd1Q99JT6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tlcd1Q99JT6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tlcd1Q99JT6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms