Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 PNS1YOR161C 1620 nt12.26□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 YOX1YML027W 1158 nt12.26□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 OLA1YBR025C 1185 nt12.26□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 SPE3YPR069C 882 nt12.26□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 MUP1YGR055W 1725 nt12.25□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 RPD3YNL330C 1302 nt12.24□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 CPT1YNL130C 1182 nt12.23□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 YBL111CYBL111C 2004 nt12.22□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 GGA2YHR108W 1758 nt12.19□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 MEP1YGR121C 1479 nt12.18□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 SGA1YIL099W 1650 nt12.18□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 GPM1YKL152C 744 nt12.18□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 ZIM17YNL310C 525 nt12.17□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 CST26YBR042C 1194 nt12.17□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 AAC3YBR085W 924 nt12.17□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 JHD1YER051W 1479 nt12.16□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 RPC31YNL151C 756 nt12.16□□□□□ -0.46
TY2B-BQ12491 AVO2YMR068W 1281 nt12.14□□□□□ -0.47
TY2B-BQ12491 ADH6YMR318C 1083 nt12.13□□□□□ -0.47
TY2B-BQ12491 HXT8YJL214W 1710 nt12.13□□□□□ -0.47
TY2B-BQ12491 ZAP1YJL056C 2643 nt12.11□□□□□ -0.47
TY2B-BQ12491 TIM50YPL063W 1431 nt12.1□□□□□ -0.47
TY2B-BQ12491 SPT20YOL148C 1815 nt12.09□□□□□ -0.47
TY2B-BQ12491 HOL1YNR055C 1761 nt12.08□□□□□ -0.47
TY2B-BQ12491 TMS1YDR105C 1422 nt12.08□□□□□ -0.48
TY2B-BQ12491 YIR035CYIR035C 765 nt12.07□□□□□ -0.48
TY2B-BQ12491 YJL009WYJL009W 327 nt12.07□□□□□ -0.48
TY2B-BQ12491 UGP1YKL035W 1500 nt12.07□□□□□ -0.48
TY2B-BQ12491 GAL83YER027C 1254 nt12.06□□□□□ -0.48
TY2B-BQ12491 SSL2YIL143C 2532 nt12.06□□□□□ -0.48
TY2B-BQ12491 PMP3YDR276C 168 nt12.05□□□□□ -0.48
TY2B-BQ12491 YPQ1YOL092W 927 nt12.05□□□□□ -0.48
TY2B-BQ12491 CRN1YLR429W 1956 nt12.02□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 PDA1YER178W 1263 nt12.02□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 DPL1YDR294C 1770 nt12.01□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt12□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 AIM46YHR199C 933 nt12□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 MBF1YOR298C-A 456 nt12□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 PLB3YOL011W 2061 nt12□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 TRR2YHR106W 1029 nt12□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 YDR467CYDR467C 327 nt11.99□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 CWP2YKL096W-A 279 nt11.99□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 BUB2YMR055C 921 nt11.97□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 PRE10YOR362C 867 nt11.97□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 ODC1YPL134C 933 nt11.97□□□□□ -0.49
TY2B-BQ12491 YHR218WYHR218W 1812 nt11.95□□□□□ -0.5
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TY2B-BQ12491 YMC2YBR104W 990 nt11.94□□□□□ -0.5
TY2B-BQ12491 LDB7YBL006C 543 nt11.93□□□□□ -0.5
TY2B-BQ12491 PMU1YKL128C 888 nt11.92□□□□□ -0.5
TY2B-BQ12491 MCP1YOR228C 909 nt11.92□□□□□ -0.5
TY2B-BQ12491 POR2YIL114C 846 nt11.92□□□□□ -0.5
TY2B-BQ12491 YGL081WYGL081W 963 nt11.9□□□□□ -0.5
TY2B-BQ12491 NMA2YGR010W 1188 nt11.9□□□□□ -0.5
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TY2B-BQ12491 YJR142WYJR142W 1029 nt11.9□□□□□ -0.51
TY2B-BQ12491 LRO1YNR008W 1986 nt11.89□□□□□ -0.51
TY2B-BQ12491 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt11.89□□□□□ -0.51
TY2B-BQ12491 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt11.89□□□□□ -0.51
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TY2B-BQ12491 PTH2YBL057C 627 nt11.89□□□□□ -0.51
TY2B-BQ12491 MPH3YJR160C 1809 nt11.88□□□□□ -0.51
TY2B-BQ12491 SPS1YDR523C 1473 nt11.87□□□□□ -0.51
TY2B-BQ12491 ARO3YDR035W 1113 nt11.87□□□□□ -0.51
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TY2B-BQ12491 ALG7YBR243C 1347 nt11.85□□□□□ -0.51
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TY2B-BQ12491 AIM20YIL158W 615 nt11.84□□□□□ -0.51
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TY2B-BQ12491 YER152CYER152C 1332 nt11.83□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 YPL067CYPL067C 597 nt11.82□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 AAT1YKL106W 1356 nt11.8□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 TPN1YGL186C 1740 nt11.8□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 PRS4YBL068W 981 nt11.79□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 LGE1YPL055C 999 nt11.79□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 OSM1YJR051W 1506 nt11.79□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 MDM35YKL053C-A 261 nt11.78□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 BUD31YCR063W 474 nt11.77□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 TES1YJR019C 1050 nt11.77□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 YLR184WYLR184W 348 nt11.77□□□□□ -0.52
TY2B-BQ12491 CYS4YGR155W 1524 nt11.76□□□□□ -0.53
TY2B-BQ12491 RCF1YML030W 480 nt11.76□□□□□ -0.53
TY2B-BQ12491 EHT1YBR177C 1356 nt11.76□□□□□ -0.53
TY2B-BQ12491 DIP5YPL265W 1827 nt11.75□□□□□ -0.53
TY2B-BQ12491 AGP3YFL055W 1677 nt11.75□□□□□ -0.53
TY2B-BQ12491 MSI1YBR195C 1269 nt11.73□□□□□ -0.53
TY2B-BQ12491 AAD14YNL331C 1131 nt11.71□□□□□ -0.54
TY2B-BQ12491 NPP2YEL016C 1482 nt11.7□□□□□ -0.54
TY2B-BQ12491 ERG10YPL028W 1197 nt11.69□□□□□ -0.54
TY2B-BQ12491 IMD1YAR073W 1212 nt11.69□□□□□ -0.54
TY2B-BQ12491 STS1YIR011C 960 nt11.68□□□□□ -0.54
TY2B-BQ12491 snR30snR30 606 nt11.68□□□□□ -0.54
TY2B-BQ12491 SUN4YNL066W 1263 nt11.67□□□□□ -0.54
TY2B-BQ12491 DPM1YPR183W 804 nt11.67□□□□□ -0.54
TY2B-BQ12491 NAF1YNL124W 1479 nt11.66□□□□□ -0.54
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