Protein–RNA interactions for Protein: Q12298

YDR061W, Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein YDR061W, yeastyeast

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR061WQ12298 REX2YLR059C 810 nt7.84□□□□□ -1.15
YDR061WQ12298 VBA3YCL069W 1377 nt7.84□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 YMR210WYMR210W 1350 nt7.84□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 ELO1YJL196C 933 nt7.83□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 KAE1YKR038C 1161 nt7.83□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 HAP5YOR358W 729 nt7.83□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 SUV3YPL029W 2214 nt7.83□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 TRP2YER090W 1524 nt7.83□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 FRA1YLL029W 2250 nt7.82□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 KEL3YPL263C 1956 nt7.81□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 YNL190WYNL190W 615 nt7.81□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 THI6YPL214C 1623 nt7.81□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 YMR206WYMR206W 942 nt7.8□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 SDH8YBR269C 417 nt7.8□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.79□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.79□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.79□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.79□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.79□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.79□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.79□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 GDH1YOR375C 1365 nt7.79□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 RPN14YGL004C 1254 nt7.78□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 SWT21YNL187W 1074 nt7.78□□□□□ -1.16
YDR061WQ12298 PFS2YNL317W 1398 nt7.77□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 LSP1YPL004C 1026 nt7.77□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 snR31snR31 225 nt7.77□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.77□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.77□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.77□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YIL177CYIL177C 5277 nt7.76□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YBL095WYBL095W 813 nt7.76□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 SRP54YPR088C 1626 nt7.76□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 SRM1YGL097W 1449 nt7.76□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 MFT1YML062C 1179 nt7.75□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 PRE5YMR314W 705 nt7.75□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 GPM1YKL152C 744 nt7.74□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YMR166CYMR166C 1107 nt7.74□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YPT11YNL304W 1254 nt7.74□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YLR072WYLR072W 2082 nt7.74□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 BAP3YDR046C 1815 nt7.73□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YFR020WYFR020W 699 nt7.73□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 ADA2YDR448W 1305 nt7.73□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 HSV2YGR223C 1347 nt7.73□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 SFL1YOR140W 2301 nt7.73□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 MET1YKR069W 1782 nt7.72□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 RSM7YJR113C 744 nt7.72□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 YKL053WYKL053W 375 nt7.72□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 CRC1YOR100C 984 nt7.72□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 ALR1YOL130W 2580 nt7.72□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 AAT1YKL106W 1356 nt7.71□□□□□ -1.17
YDR061WQ12298 TAD2YJL035C 753 nt7.71□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 PET18YCR020C 648 nt7.7□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 LAS17YOR181W 1902 nt7.69□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 DIA4YHR011W 1341 nt7.69□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 FTH1YBR207W 1398 nt7.69□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.69□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.69□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.69□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 THI3YDL080C 1830 nt7.67□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 SLM3YDL033C 1254 nt7.67□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 UTR5YEL035C 501 nt7.67□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 AIM34YMR003W 597 nt7.67□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 MDH2YOL126C 1134 nt7.67□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 ELP4YPL101W 1371 nt7.67□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 YPL247CYPL247C 1572 nt7.66□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 RRT14YIL127C 621 nt7.65□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 YLR460CYLR460C 1131 nt7.65□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 YPR084WYPR084W 1371 nt7.65□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 YMC2YBR104W 990 nt7.65□□□□□ -1.18
YDR061WQ12298 PET494YNR045W 1470 nt7.64□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.64□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 KGD2YDR148C 1392 nt7.63□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 NME1NME1 340 nt7.63□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 AAC3YBR085W 924 nt7.63□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 GGA2YHR108W 1758 nt7.63□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 SAN1YDR143C 1833 nt7.62□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 CAK1YFL029C 1107 nt7.62□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 ADE1YAR015W 921 nt7.62□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 FUS3YBL016W 1062 nt7.62□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 NSG2YNL156C 900 nt7.62□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 YER156CYER156C 1017 nt7.61□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 YJL043WYJL043W 774 nt7.61□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 YJR149WYJR149W 1215 nt7.61□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 PTC6YCR079W 1329 nt7.6□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 GAS1YMR307W 1680 nt7.6□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 CHA1YCL064C 1083 nt7.59□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 ATP10YLR393W 840 nt7.59□□□□□ -1.19
YDR061WQ12298 ITR1YDR497C 1755 nt7.59□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 CHS7YHR142W 951 nt7.58□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 TDH1YJL052W 999 nt7.58□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 LEA1YPL213W 717 nt7.58□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 YLR173WYLR173W 1827 nt7.57□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 GGC1YDL198C 903 nt7.57□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 snR86snR86 1004 nt7.57□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 MRS4YKR052C 915 nt7.57□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 RPS6AYPL090C 711 nt7.57□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 RPS6BYBR181C 711 nt7.57□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 OCH1YGL038C 1443 nt7.57□□□□□ -1.2
YDR061WQ12298 PRC1YMR297W 1599 nt7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms