Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 MEP1YGR121C 1479 nt8.14□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 MRP1YDR347W 966 nt8.14□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 YJL009WYJL009W 327 nt8.14□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 MFT1YML062C 1179 nt8.14□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 CYT1YOR065W 930 nt8.14□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 RHO1YPR165W 630 nt8.13□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 SHC1YER096W 1539 nt8.13□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 MTO1YGL236C 2010 nt8.12□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 ELP4YPL101W 1371 nt8.11□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 snR86snR86 1004 nt8.11□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 HEM14YER014W 1620 nt8.11□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 GDH1YOR375C 1365 nt8.1□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.1□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.1□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.1□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.1□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.1□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.1□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.1□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 MCM5YLR274W 2328 nt8.09□□□□□ -1.11
PUF2Q12221 YPR084WYPR084W 1371 nt8.09□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.08□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 THI73YLR004C 1572 nt8.08□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 FET5YFL041W 1869 nt8.08□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 YPT31YER031C 672 nt8.07□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 TAD2YJL035C 753 nt8.07□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 TRP2YER090W 1524 nt8.07□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 ATP2YJR121W 1536 nt8.07□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 MAS1YLR163C 1389 nt8.07□□□□□ -1.12 RIP-Chip
PUF2Q12221 PUP3YER094C 618 nt8.06□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 YRF1-2YER190W 5046 nt8.06□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 RPL12BYDR418W 498 nt8.05□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 YIL168WYIL168W 384 nt8.05□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 KAE1YKR038C 1161 nt8.05□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 YMR206WYMR206W 942 nt8.05□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 YLR072WYLR072W 2082 nt8.04□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 THI6YPL214C 1623 nt8.04□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 LRO1YNR008W 1986 nt8.04□□□□□ -1.12
PUF2Q12221 EHT1YBR177C 1356 nt8.02□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 TDH1YJL052W 999 nt8.02□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 ADE1YAR015W 921 nt8.02□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 HXT8YJL214W 1710 nt8.02□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 TOS1YBR162C 1368 nt8.01□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 JHD1YER051W 1479 nt8□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 HXT11YOL156W 1704 nt8□□□□□ -1.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 NBA1YOL070C 1506 nt7.98□□□□□ -1.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 TIM50YPL063W 1431 nt7.98□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.98□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 ABP1YCR088W 1779 nt7.97□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 YJL043WYJL043W 774 nt7.97□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 SRM1YGL097W 1449 nt7.96□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 NUP53YMR153W 1428 nt7.96□□□□□ -1.13
PUF2Q12221 DIP5YPL265W 1827 nt7.96□□□□□ -1.14 RIP-Chip
PUF2Q12221 EDC2YER035W 438 nt7.95□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 INO1YJL153C 1602 nt7.95□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 BUD31YCR063W 474 nt7.94□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 HIS3YOR202W 663 nt7.94□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 PRE10YOR362C 867 nt7.94□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 RSC4YKR008W 1878 nt7.94□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 RCF1YML030W 480 nt7.93□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 PMU1YKL128C 888 nt7.91□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 FUS3YBL016W 1062 nt7.91□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 YOR268CYOR268C 399 nt7.91□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 LEA1YPL213W 717 nt7.91□□□□□ -1.14
PUF2Q12221 YHL008CYHL008C 1884 nt7.89□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 PET494YNR045W 1470 nt7.89□□□□□ -1.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 ALG7YBR243C 1347 nt7.89□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 HAC1YFL031W 717 nt7.89□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 APT1YML022W 564 nt7.89□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 ARO3YDR035W 1113 nt7.88□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 RRT6YGL146C 936 nt7.88□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 PSP2YML017W 1782 nt7.88□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 NDE2YDL085W 1638 nt7.87□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 FRA1YLL029W 2250 nt7.86□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 WSC3YOL105C 1671 nt7.86□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 FTH1YBR207W 1398 nt7.85□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 WSC4YHL028W 1818 nt7.85□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 MRN1YPL184C 1839 nt7.85□□□□□ -1.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 NCA3YJL116C 1014 nt7.85□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 ARG7YMR062C 1326 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 GLY1YEL046C 1164 nt7.84□□□□□ -1.15
PUF2Q12221 PNS1YOR161C 1620 nt7.84□□□□□ -1.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 TGL5YOR081C 2250 nt7.83□□□□□ -1.16
PUF2Q12221 HXK1YFR053C 1458 nt7.83□□□□□ -1.16
PUF2Q12221 TDA4YJR116W 840 nt7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.9 ms