Protein–RNA interactions for Protein: Q12209

FRE8, Probable ferric reductase transmembrane component 8, yeastyeast

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE8Q12209 AAC3YBR085W 924 nt6.97□□□□□ -1.29
FRE8Q12209 POP2YNR052C 1302 nt6.97□□□□□ -1.29
FRE8Q12209 ENO1YGR254W 1314 nt6.96□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 VBA3YCL069W 1377 nt6.95□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YDR306CYDR306C 1437 nt6.95□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.95□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YNL190WYNL190W 615 nt6.94□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 RCR1YBR005W 642 nt6.94□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 SRM1YGL097W 1449 nt6.93□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 GNP1YDR508C 1992 nt6.93□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 ADE2YOR128C 1716 nt6.93□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YLR072WYLR072W 2082 nt6.93□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.93□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 snR4snR4 186 nt6.93□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 TMS1YDR105C 1422 nt6.93□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 snR86snR86 1004 nt6.92□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 ERO1YML130C 1692 nt6.92□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YIL177CYIL177C 5277 nt6.92□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.91□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.91□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.91□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YLR280CYLR280C 351 nt6.91□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YMR210WYMR210W 1350 nt6.91□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 SNU66YOR308C 1764 nt6.9□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YFR020WYFR020W 699 nt6.9□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YGR210CYGR210C 1236 nt6.9□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 YJR154WYJR154W 1041 nt6.9□□□□□ -1.3
FRE8Q12209 MAM3YOL060C 2121 nt6.89□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 RSM7YJR113C 744 nt6.89□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 LEA1YPL213W 717 nt6.89□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 FTH1YBR207W 1398 nt6.89□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 LAS17YOR181W 1902 nt6.89□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 PUS7YOR243C 2031 nt6.88□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 NDE1YMR145C 1683 nt6.88□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 YJL009WYJL009W 327 nt6.88□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 YJR149WYJR149W 1215 nt6.87□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.86□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.86□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.86□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.86□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.86□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 YIR035CYIR035C 765 nt6.86□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 YPL108WYPL108W 507 nt6.86□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 DUS3YLR401C 2007 nt6.86□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 NME1NME1 340 nt6.85□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 YBR056WYBR056W 1506 nt6.85□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 FRT1YOR324C 1809 nt6.85□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 MEP1YGR121C 1479 nt6.85□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 ADE16YLR028C 1776 nt6.85□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 BEM1YBR200W 1656 nt6.84□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 ABP1YCR088W 1779 nt6.84□□□□□ -1.31
FRE8Q12209 BUD20YLR074C 501 nt6.83□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 BUB2YMR055C 921 nt6.83□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 HIS3YOR202W 663 nt6.83□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 FCY1YPR062W 477 nt6.82□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 YJL160CYJL160C 864 nt6.81□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 PMA2YPL036W 2844 nt6.81□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 PAU21YOR394W 495 nt6.8□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 PAU22YPL282C 495 nt6.8□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 DIA4YHR011W 1341 nt6.79□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 YLR460CYLR460C 1131 nt6.79□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 YMR166CYMR166C 1107 nt6.79□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 YOR343CYOR343C 327 nt6.79□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 GGC1YDL198C 903 nt6.78□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 MET22YOL064C 1074 nt6.78□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 CTF3YLR381W 2202 nt6.78□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 CCR4YAL021C 2514 nt6.78□□□□□ -1.32
FRE8Q12209 GRH1YDR517W 1119 nt6.77□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 RNA170RNA170 169 nt6.77□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 CHS7YHR142W 951 nt6.76□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 HRA1HRA1 564 nt6.76□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 OLA1YBR025C 1185 nt6.76□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 PFS2YNL317W 1398 nt6.76□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 INO1YJL153C 1602 nt6.76□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 EHT1YBR177C 1356 nt6.75□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 NDE2YDL085W 1638 nt6.75□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 RPL12BYDR418W 498 nt6.74□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 RRT14YIL127C 621 nt6.74□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 MDH2YOL126C 1134 nt6.74□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 LSP1YPL004C 1026 nt6.74□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 TIF3YPR163C 1311 nt6.74□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 MRN1YPL184C 1839 nt6.73□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 BUD31YCR063W 474 nt6.73□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 MRP1YDR347W 966 nt6.73□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 GLY1YEL046C 1164 nt6.73□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 YNL140CYNL140C 570 nt6.73□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 LRO1YNR008W 1986 nt6.73□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 HSV2YGR223C 1347 nt6.73□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.72□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.72□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.72□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 PDC6YGR087C 1692 nt6.71□□□□□ -1.33
FRE8Q12209 PET18YCR020C 648 nt6.71□□□□□ -1.34
FRE8Q12209 YER156CYER156C 1017 nt6.71□□□□□ -1.34
FRE8Q12209 CAK1YFL029C 1107 nt6.71□□□□□ -1.34
FRE8Q12209 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.71□□□□□ -1.34
FRE8Q12209 AIM34YMR003W 597 nt6.71□□□□□ -1.34
FRE8Q12209 TGL5YOR081C 2250 nt6.71□□□□□ -1.34
FRE8Q12209 OCH1YGL038C 1443 nt6.7□□□□□ -1.34
FRE8Q12209 CHA1YCL064C 1083 nt6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.2 ms