Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 HIS3YOR202W 663 nt7.66□□□□□ -1.18
SNF12P53628 TMS1YDR105C 1422 nt7.66□□□□□ -1.18
SNF12P53628 YEL023CYEL023C 2049 nt7.66□□□□□ -1.18
SNF12P53628 URH1YDR400W 1023 nt7.65□□□□□ -1.18
SNF12P53628 MAM3YOL060C 2121 nt7.64□□□□□ -1.19
SNF12P53628 MLS1YNL117W 1665 nt7.64□□□□□ -1.19
SNF12P53628 CHA1YCL064C 1083 nt7.64□□□□□ -1.19
SNF12P53628 PAR32YDL173W 888 nt7.64□□□□□ -1.19
SNF12P53628 YBR056WYBR056W 1506 nt7.62□□□□□ -1.19
SNF12P53628 MEP1YGR121C 1479 nt7.62□□□□□ -1.19
SNF12P53628 COG1YGL223C 1254 nt7.62□□□□□ -1.19
SNF12P53628 CDD1YLR245C 429 nt7.62□□□□□ -1.19
SNF12P53628 YPL041CYPL041C 624 nt7.62□□□□□ -1.19
SNF12P53628 ITR1YDR497C 1755 nt7.61□□□□□ -1.19
SNF12P53628 ECM10YEL030W 1935 nt7.61□□□□□ -1.19
SNF12P53628 LYS20YDL182W 1287 nt7.61□□□□□ -1.19
SNF12P53628 NAS2YIL007C 663 nt7.61□□□□□ -1.19
SNF12P53628 ATP10YLR393W 840 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF12P53628 SPE2YOL052C 1191 nt7.6□□□□□ -1.19
SNF12P53628 PRC1YMR297W 1599 nt7.59□□□□□ -1.19
SNF12P53628 YJL009WYJL009W 327 nt7.59□□□□□ -1.19
SNF12P53628 YPT11YNL304W 1254 nt7.59□□□□□ -1.19
SNF12P53628 GGC1YDL198C 903 nt7.58□□□□□ -1.2
SNF12P53628 LCP5YER127W 1074 nt7.58□□□□□ -1.2
SNF12P53628 SEN2YLR105C 1134 nt7.58□□□□□ -1.2
SNF12P53628 YPL264CYPL264C 1062 nt7.58□□□□□ -1.2
SNF12P53628 THP3YPR045C 1413 nt7.58□□□□□ -1.2
SNF12P53628 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.58□□□□□ -1.2
SNF12P53628 PMT7YDR307W 1989 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF12P53628 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF12P53628 IGD1YFR017C 588 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF12P53628 SPE4YLR146C 903 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF12P53628 ERG6YML008C 1152 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF12P53628 ARA2YMR041C 1008 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF12P53628 KRE1YNL322C 942 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF12P53628 FRT1YOR324C 1809 nt7.57□□□□□ -1.2
SNF12P53628 FSH2YMR222C 672 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF12P53628 TOP3YLR234W 1971 nt7.56□□□□□ -1.2
SNF12P53628 UBP13YBL067C 2244 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF12P53628 MRN1YPL184C 1839 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF12P53628 YJR149WYJR149W 1215 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF12P53628 REG2YBR050C 1017 nt7.55□□□□□ -1.2
SNF12P53628 NDE2YDL085W 1638 nt7.54□□□□□ -1.2
SNF12P53628 BEM1YBR200W 1656 nt7.54□□□□□ -1.2
SNF12P53628 STF1YDL130W-A 261 nt7.53□□□□□ -1.2
SNF12P53628 YJL064WYJL064W 396 nt7.53□□□□□ -1.2
SNF12P53628 YKR012CYKR012C 378 nt7.53□□□□□ -1.2
SNF12P53628 YLR122CYLR122C 378 nt7.53□□□□□ -1.2
SNF12P53628 VBA3YCL069W 1377 nt7.53□□□□□ -1.2
SNF12P53628 SDS24YBR214W 1584 nt7.53□□□□□ -1.2
SNF12P53628 NAP1YKR048C 1254 nt7.52□□□□□ -1.21
SNF12P53628 BUB2YMR055C 921 nt7.52□□□□□ -1.21
SNF12P53628 INO1YJL153C 1602 nt7.52□□□□□ -1.21
SNF12P53628 TIF3YPR163C 1311 nt7.52□□□□□ -1.21
SNF12P53628 CTF3YLR381W 2202 nt7.51□□□□□ -1.21
SNF12P53628 BUD31YCR063W 474 nt7.51□□□□□ -1.21
SNF12P53628 TOM20YGR082W 552 nt7.51□□□□□ -1.21
SNF12P53628 LRO1YNR008W 1986 nt7.51□□□□□ -1.21
SNF12P53628 GLY1YEL046C 1164 nt7.5□□□□□ -1.21
SNF12P53628 YIR035CYIR035C 765 nt7.5□□□□□ -1.21
SNF12P53628 PAU19YMR325W 375 nt7.5□□□□□ -1.21
SNF12P53628 YNL140CYNL140C 570 nt7.5□□□□□ -1.21
SNF12P53628 ERR3YMR323W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
SNF12P53628 ERR1YOR393W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
SNF12P53628 ERR2YPL281C 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
SNF12P53628 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.49□□□□□ -1.21
SNF12P53628 PHB2YGR231C 933 nt7.49□□□□□ -1.21
SNF12P53628 ADH3YMR083W 1128 nt7.49□□□□□ -1.21
SNF12P53628 YMR253CYMR253C 1245 nt7.49□□□□□ -1.21
SNF12P53628 DIP5YPL265W 1827 nt7.49□□□□□ -1.21
SNF12P53628 MET13YGL125W 1803 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 GUT1YHL032C 2130 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 PMA2YPL036W 2844 nt7.48□□□□□ -1.21
SNF12P53628 FLX1YIL134W 936 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF12P53628 RSM7YJR113C 744 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF12P53628 IPL1YPL209C 1104 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF12P53628 TGL5YOR081C 2250 nt7.46□□□□□ -1.22
SNF12P53628 WSC4YHL028W 1818 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF12P53628 HXT9YJL219W 1704 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF12P53628 YFR020WYFR020W 699 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF12P53628 INM1YHR046C 888 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF12P53628 PUP1YOR157C 786 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF12P53628 YTH1YPR107C 627 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF12P53628 YER152CYER152C 1332 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF12P53628 EHT1YBR177C 1356 nt7.45□□□□□ -1.22
SNF12P53628 RNA170RNA170 169 nt7.44□□□□□ -1.22
SNF12P53628 RRT6YGL146C 936 nt7.43□□□□□ -1.22
SNF12P53628 FAF1YIL019W 1041 nt7.43□□□□□ -1.22
SNF12P53628 NDE1YMR145C 1683 nt7.43□□□□□ -1.22
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