Protein–RNA interactions for Protein: P47172

YJR141W, Uncharacterized protein YJR141W, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR141WP47172 GNP1YDR508C 1992 nt7.53□□□□□ -1.2
YJR141WP47172 GGA2YHR108W 1758 nt7.52□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.52□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.52□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.52□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.52□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.52□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YPL108WYPL108W 507 nt7.52□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 POP2YNR052C 1302 nt7.52□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 SNU66YOR308C 1764 nt7.51□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YIL177CYIL177C 5277 nt7.5□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 GGC1YDL198C 903 nt7.5□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.5□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YLR460CYLR460C 1131 nt7.48□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YMR166CYMR166C 1107 nt7.48□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 THI3YDL080C 1830 nt7.48□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 INH1YDL181W 258 nt7.47□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 YDR467CYDR467C 327 nt7.47□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 GPM1YKL152C 744 nt7.47□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 FCY1YPR062W 477 nt7.47□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 BEM1YBR200W 1656 nt7.47□□□□□ -1.21
YJR141WP47172 LEU4YNL104C 1860 nt7.45□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 CCR4YAL021C 2514 nt7.44□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.44□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.44□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.44□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 CHS7YHR142W 951 nt7.44□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 YIR035CYIR035C 765 nt7.44□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 CTF3YLR381W 2202 nt7.44□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 ADE16YLR028C 1776 nt7.43□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 YJL160CYJL160C 864 nt7.43□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 AIM34YMR003W 597 nt7.43□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 YBL095WYBL095W 813 nt7.43□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 AAC3YBR085W 924 nt7.43□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 TMS1YDR105C 1422 nt7.43□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 YDR306CYDR306C 1437 nt7.43□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 TOP3YLR234W 1971 nt7.41□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 AFG2YLR397C 2343 nt7.4□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 RRT14YIL127C 621 nt7.4□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 LSP1YPL004C 1026 nt7.4□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 OCH1YGL038C 1443 nt7.4□□□□□ -1.22
YJR141WP47172 FET5YFL041W 1869 nt7.38□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 CAK1YFL029C 1107 nt7.38□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 ORT1YOR130C 879 nt7.38□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 OLA1YBR025C 1185 nt7.38□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 YMR210WYMR210W 1350 nt7.37□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 MET22YOL064C 1074 nt7.37□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 ITR1YDR497C 1755 nt7.37□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 PDC6YGR087C 1692 nt7.37□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 YIL108WYIL108W 2091 nt7.37□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 PFS2YNL317W 1398 nt7.36□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 YER156CYER156C 1017 nt7.36□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 EMC3YKL207W 762 nt7.36□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 BUB2YMR055C 921 nt7.36□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 PET18YCR020C 648 nt7.35□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 GRH1YDR517W 1119 nt7.35□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 MRS4YKR052C 915 nt7.35□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 PAU21YOR394W 495 nt7.35□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 PAU22YPL282C 495 nt7.35□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 YMC2YBR104W 990 nt7.35□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 snR4snR4 186 nt7.34□□□□□ -1.23
YJR141WP47172 BUD20YLR074C 501 nt7.33□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 MFT1YML062C 1179 nt7.33□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 RNA170RNA170 169 nt7.33□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 YOR343CYOR343C 327 nt7.33□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 NPP2YEL016C 1482 nt7.32□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 HRA1HRA1 564 nt7.32□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 YPR084WYPR084W 1371 nt7.32□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 YBR056WYBR056W 1506 nt7.32□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 MRP1YDR347W 966 nt7.31□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 YJL009WYJL009W 327 nt7.31□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 YJR149WYJR149W 1215 nt7.3□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 ATP10YLR393W 840 nt7.3□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 ADA2YDR448W 1305 nt7.29□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 HSV2YGR223C 1347 nt7.29□□□□□ -1.24
YJR141WP47172 SLM3YDL033C 1254 nt7.27□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 RPL12BYDR418W 498 nt7.27□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 YPT31YER031C 672 nt7.27□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 BXI1YNL305C 894 nt7.27□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 RHO1YPR165W 630 nt7.27□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 AAT1YKL106W 1356 nt7.27□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 GDH1YOR375C 1365 nt7.27□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 HXT13YEL069C 1695 nt7.27□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 snR86snR86 1004 nt7.26□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 PUP3YER094C 618 nt7.26□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 YMR206WYMR206W 942 nt7.26□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 RPS6AYPL090C 711 nt7.26□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 RPS6BYBR181C 711 nt7.26□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 MSB3YNL293W 1902 nt7.26□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 PRC1YMR297W 1599 nt7.25□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 PUS7YOR243C 2031 nt7.25□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 CHA1YCL064C 1083 nt7.25□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 TAD2YJL035C 753 nt7.25□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 YNL040WYNL040W 1371 nt7.23□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 ELP4YPL101W 1371 nt7.23□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 ATP2YJR121W 1536 nt7.23□□□□□ -1.25
YJR141WP47172 UTR5YEL035C 501 nt7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms