Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.2□□□□□ -0.94
VID28P40547 YMR007WYMR007W 381 nt9.19□□□□□ -0.94
VID28P40547 LRO1YNR008W 1986 nt9.17□□□□□ -0.94
VID28P40547 YMR210WYMR210W 1350 nt9.17□□□□□ -0.94
VID28P40547 POP2YNR052C 1302 nt9.17□□□□□ -0.94
VID28P40547 RRT14YIL127C 621 nt9.17□□□□□ -0.94
VID28P40547 OLA1YBR025C 1185 nt9.17□□□□□ -0.94
VID28P40547 LEA1YPL213W 717 nt9.17□□□□□ -0.94
VID28P40547 Q0010Q0010 387 nt9.17□□□□□ -0.94
VID28P40547 MET8YBR213W 825 nt9.16□□□□□ -0.94
VID28P40547 SHC1YER096W 1539 nt9.15□□□□□ -0.94
VID28P40547 EHT1YBR177C 1356 nt9.15□□□□□ -0.94
VID28P40547 HIS3YOR202W 663 nt9.15□□□□□ -0.94
VID28P40547 FTH1YBR207W 1398 nt9.13□□□□□ -0.95
VID28P40547 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.13□□□□□ -0.95
VID28P40547 RHO1YPR165W 630 nt9.13□□□□□ -0.95
VID28P40547 HBS1YKR084C 1836 nt9.12□□□□□ -0.95
VID28P40547 DIP5YPL265W 1827 nt9.12□□□□□ -0.95
VID28P40547 YOR072WYOR072W 315 nt9.12□□□□□ -0.95
VID28P40547 YER156CYER156C 1017 nt9.11□□□□□ -0.95
VID28P40547 BXI1YNL305C 894 nt9.11□□□□□ -0.95
VID28P40547 DUR3YHL016C 2208 nt9.11□□□□□ -0.95
VID28P40547 BUD31YCR063W 474 nt9.09□□□□□ -0.95
VID28P40547 YJR154WYJR154W 1041 nt9.09□□□□□ -0.95
VID28P40547 MIM1YOL026C 342 nt9.09□□□□□ -0.95
VID28P40547 HXT8YJL214W 1710 nt9.08□□□□□ -0.96
VID28P40547 UTR5YEL035C 501 nt9.08□□□□□ -0.96
VID28P40547 PUP3YER094C 618 nt9.08□□□□□ -0.96
VID28P40547 RPS6AYPL090C 711 nt9.08□□□□□ -0.96
VID28P40547 RPS6BYBR181C 711 nt9.08□□□□□ -0.96
VID28P40547 INO1YJL153C 1602 nt9.07□□□□□ -0.96
VID28P40547 THI73YLR004C 1572 nt9.07□□□□□ -0.96
VID28P40547 MRN1YPL184C 1839 nt9.06□□□□□ -0.96
VID28P40547 RCR1YBR005W 642 nt9.06□□□□□ -0.96
VID28P40547 ILV2YMR108W 2064 nt9.05□□□□□ -0.96
VID28P40547 MEX67YPL169C 1800 nt9.04□□□□□ -0.96
VID28P40547 ORT1YOR130C 879 nt9.04□□□□□ -0.96
VID28P40547 MDL2YPL270W 2322 nt9.04□□□□□ -0.96
VID28P40547 ESBP6YNL125C 2022 nt9.04□□□□□ -0.96
VID28P40547 GLY1YEL046C 1164 nt9.03□□□□□ -0.96
VID28P40547 BUD20YLR074C 501 nt9.03□□□□□ -0.96
VID28P40547 ATP2YJR121W 1536 nt9.03□□□□□ -0.96
VID28P40547 WSC4YHL028W 1818 nt9.03□□□□□ -0.96
VID28P40547 GAL2YLR081W 1725 nt9.02□□□□□ -0.97
VID28P40547 ARO3YDR035W 1113 nt9.01□□□□□ -0.97
VID28P40547 YPT31YER031C 672 nt9.01□□□□□ -0.97
VID28P40547 RCF1YML030W 480 nt9.01□□□□□ -0.97
VID28P40547 TIM50YPL063W 1431 nt9□□□□□ -0.97
VID28P40547 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9□□□□□ -0.97
VID28P40547 NDE2YDL085W 1638 nt9□□□□□ -0.97
VID28P40547 ALG7YBR243C 1347 nt9□□□□□ -0.97
VID28P40547 JHD1YER051W 1479 nt8.99□□□□□ -0.97
VID28P40547 TGL5YOR081C 2250 nt8.99□□□□□ -0.97
VID28P40547 ADA2YDR448W 1305 nt8.99□□□□□ -0.97
VID28P40547 TDA4YJR116W 840 nt8.98□□□□□ -0.97
VID28P40547 MFT1YML062C 1179 nt8.97□□□□□ -0.97
VID28P40547 snR4snR4 186 nt8.97□□□□□ -0.97
VID28P40547 TIF3YPR163C 1311 nt8.97□□□□□ -0.97
VID28P40547 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.96□□□□□ -0.98
VID28P40547 WSC3YOL105C 1671 nt8.96□□□□□ -0.98
VID28P40547 INM1YHR046C 888 nt8.95□□□□□ -0.98
VID28P40547 YNL140CYNL140C 570 nt8.95□□□□□ -0.98
VID28P40547 YPR084WYPR084W 1371 nt8.95□□□□□ -0.98
VID28P40547 PRE10YOR362C 867 nt8.94□□□□□ -0.98
VID28P40547 GRH1YDR517W 1119 nt8.93□□□□□ -0.98
VID28P40547 YIL168WYIL168W 384 nt8.92□□□□□ -0.98
VID28P40547 YMR206WYMR206W 942 nt8.92□□□□□ -0.98
VID28P40547 MRP7YNL005C 1116 nt8.92□□□□□ -0.98
VID28P40547 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.92□□□□□ -0.98
VID28P40547 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.92□□□□□ -0.98
VID28P40547 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.92□□□□□ -0.98
VID28P40547 ELP4YPL101W 1371 nt8.9□□□□□ -0.98
VID28P40547 DIA4YHR011W 1341 nt8.9□□□□□ -0.98
VID28P40547 YGR139WYGR139W 339 nt8.9□□□□□ -0.98
VID28P40547 YOR343CYOR343C 327 nt8.9□□□□□ -0.98
VID28P40547 PAU21YOR394W 495 nt8.9□□□□□ -0.98
VID28P40547 PAU22YPL282C 495 nt8.9□□□□□ -0.98
VID28P40547 DUS3YLR401C 2007 nt8.89□□□□□ -0.99
VID28P40547 PMU1YKL128C 888 nt8.89□□□□□ -0.99
VID28P40547 ELP6YMR312W 822 nt8.89□□□□□ -0.99
VID28P40547 TOK1YJL093C 2076 nt8.89□□□□□ -0.99
VID28P40547 BSP1YPR171W 1731 nt8.88□□□□□ -0.99
VID28P40547 GDH1YOR375C 1365 nt8.88□□□□□ -0.99
VID28P40547 SNP1YIL061C 903 nt8.88□□□□□ -0.99
VID28P40547 MRP1YDR347W 966 nt8.87□□□□□ -0.99
VID28P40547 TAD2YJL035C 753 nt8.87□□□□□ -0.99
VID28P40547 DTR1YBR180W 1719 nt8.87□□□□□ -0.99
VID28P40547 YGR137WYGR137W 375 nt8.86□□□□□ -0.99
VID28P40547 TDH1YJL052W 999 nt8.86□□□□□ -0.99
VID28P40547 PMT1YDL095W 2454 nt8.86□□□□□ -0.99
VID28P40547 KTR4YBR199W 1395 nt8.86□□□□□ -0.99
VID28P40547 ARG7YMR062C 1326 nt8.85□□□□□ -0.99
VID28P40547 RPL12BYDR418W 498 nt8.85□□□□□ -0.99
VID28P40547 HRA1HRA1 564 nt8.85□□□□□ -0.99
VID28P40547 TPO1YLL028W 1761 nt8.85□□□□□ -0.99
VID28P40547 MTC6YHR151C 1581 nt8.85□□□□□ -0.99
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